כ-150 מחנכים ובעלי תפקידים מאמי"ת משתלמים ב"בית-מדרש לומד למחנכים" במסגרת הטמעת המעבר מבית-ספר לבית-חינוך נערכות בשנת תשס"ה השתלמויות אזוריות למחנכי רשת אמי"ת תחת הכותרת: "בית-מדרש לומד למחנכים".
	כידוע, למחנכי הכיתות תפקיד מרכזי בהובלת שינוי בתוך בית-הספר. לכן היעד המרכזי בהשתלמויות אלו הוא פיתוח אישי והעצמת זהותו של המחנך הדתי, בבחינת מורה דרך ומנהיג מוסרי, דתי וערכי. אחת הדרכים להשגת היעד היא הצגת "שפה חינוכית חדשה" לשיח ולדיאלוג בין כותלי בית-הספר,תוך כדי הקניית מיומנויות משופרות לניהול דיאלוג פתוח וישיר עם התלמידים, מתוך עמדה של דוגמה אישית, מחד, והתחברות עם עולמם הרוחני של התלמידים, מאידך.		בתי-המדרש פועלים בשלושה אזורים, ובראשם רבנים ופסיכולוגים. בבית המדרש בצפון: הרב יעקב ידיד, ראש ישיבת ההסדר בכרמיאל מבית-המדרש מהו"ת. בבית המדרש בדרום: הרב ראובן הכהן, ראש אולפנת מטה יהודה ומנחה בבית-הספר למנהיגות חינוכית בירושלים. בבית המדרש במרכז: הפסיכולוגים אילן בוכהולץ, עמרם קליימן ודוד ליברמן מבית-המדרש להתחדשות בראשותו של הרב דוב זינגר.